Springの基礎講習を通して、DIがある方が独立
していて便利だということは分かったのですが、
逆にDI無しの利点というものはあるのでしょうか。

DI無しのほうが、ソースのコード量自体は少なくなります。
ですので、一人で開発するならDI無しのほうがいいかもしれません。