ワークフォルダのファイルを修正してgit add ./ したが、commit を忘れてしまい、
さらにファイルを修正し add、commit したら、前にaddした修正は残らない？
やってみるとlogには出てこない。
この時、インデックス登録したことも消えるのでしょうか？

addとcommitを一度に行うcommandは無いでしょうか？

commitしなければ、残りませんよ。

> addとcommitを一度に行うcommandは無いでしょうか？

ありません。

> commitしなければ、残りませんよ。

ステージングする意味(理由)は何でしょうか？
（GitHubでもcommitしたものをやり取りしているようですが）

ざっくり言えば、仮置きです。

一つのファイルでやっていると意味が見えませんが、
複数のファイルとか、時間かけて作業する場合に、
コミットまでは不要だけど、
ひとまず仮置きしておくかって場所です。